MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni IA3902 plasmid pVir

Total Repeats: 181

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017284	TCT	2	6	6404	6409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017284	GTTTA	2	10	6420	6429	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017284	GTT	2	6	6437	6442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017284	AG	3	6	6444	6449	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017284	A	6	6	6474	6479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017284	TCATTT	2	12	6662	6673	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017284	A	6	6	6727	6732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017284	GGTTT	2	10	7620	7629	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017284	T	6	6	7631	7636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017284	T	7	7	7666	7672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017284	A	7	7	9191	9197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017284	T	6	6	11193	11198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017284	A	7	7	11225	11231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017284	A	7	7	11268	11274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017284	A	6	6	11300	11305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017284	A	6	6	11333	11338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017284	TATAAT	2	12	11341	11352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017284	AACAAA	2	12	11353	11364	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017284	A	6	6	12240	12245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017284	T	6	6	12253	12258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017284	TATT	2	8	12266	12273	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017284	A	6	6	12306	12311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017284	TAGT	2	8	12348	12355	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017284	A	6	6	14014	14019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017284	GAA	2	6	15717	15722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017284	ATTA	2	8	15725	15732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017284	A	6	6	15732	15737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017284	TAT	2	6	16041	16046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017284	A	6	6	16057	16062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017284	A	6	6	16068	16073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017284	TA	3	6	16076	16081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017284	TA	3	6	16087	16092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017284	TA	3	6	16098	16103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017284	A	6	6	16112	16117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017284	ACAAA	2	10	16132	16141	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017284	A	6	6	16169	16174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017284	T	8	8	16179	16186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017284	T	6	6	16193	16198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017284	ATT	2	6	16217	16222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017284	T	6	6	16241	16246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017284	TAA	2	6	16259	16264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017284	A	6	6	16269	16274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017284	AGA	2	6	16279	16284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017284	AAT	2	6	16316	16321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017284	TTTTG	2	10	16325	16334	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017284	ATTCT	2	10	16353	16362	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017284	TATAA	2	10	16385	16394	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017284	A	6	6	16393	16398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017284	A	6	6	16421	16426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017284	ATAA	2	8	16430	16437	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017284	TA	3	6	16440	16445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017284	AT	3	6	17815	17820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017284	AGTT	2	8	17829	17836	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017284	AACT	2	8	17841	17848	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017284	CTTTGT	3	18	18679	18696	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017284	ACTT	2	8	18721	18728	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017284	AAAAT	2	10	18764	18773	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017284	TA	3	6	18798	18803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017284	T	7	7	18842	18848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017284	A	8	8	18851	18858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017284	TAA	2	6	18862	18867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017284	TTTATA	2	12	18880	18891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017284	TTTATT	2	12	18974	18985	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017284	T	6	6	19093	19098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017284	ATTA	2	8	19283	19290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017284	TAT	2	6	19293	19298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017284	ATTTT	2	10	19303	19312	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017284	TTA	2	6	19323	19328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017284	T	8	8	19335	19342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017284	TAA	2	6	19398	19403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017284	A	15	15	19412	19426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017284	T	6	6	19437	19442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017284	T	6	6	19450	19455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017284	T	6	6	19457	19462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017284	T	6	6	19473	19478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017284	T	6	6	19505	19510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017284	T	6	6	19535	19540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017284	T	6	6	19545	19550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017284	T	8	8	19591	19598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017284	A	6	6	19599	19604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017284	T	6	6	19610	19615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017284	ATT	2	6	19629	19634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017284	T	7	7	19633	19639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017284	TTTGT	2	10	19659	19668	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017284	TATTTT	2	12	19686	19697	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017284	TATT	2	8	19759	19766	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017284	ATT	2	6	19770	19775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017284	A	6	6	21873	21878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017284	A	6	6	21895	21900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017284	TA	3	6	21914	21919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017284	A	6	6	21928	21933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017284	A	6	6	21947	21952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017284	A	8	8	22750	22757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017284	TAAA	2	8	25175	25182	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017284	TAG	2	6	25204	25209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017284	T	6	6	25238	25243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017284	T	8	8	25255	25262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017284	ATAA	2	8	25538	25545	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017284	A	6	6	25551	25556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017284	TA	3	6	25559	25564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017284	A	6	6	25584	25589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017284	TATAAT	2	12	25592	25603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017284	AACAAA	2	12	25604	25615	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_017284	TTA	2	6	26940	26945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017284	A	7	7	26956	26962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017284	A	6	6	26980	26985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017284	TTA	2	6	26993	26998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017284	T	6	6	27886	27891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017284	T	7	7	27895	27901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017284	CTT	2	6	27903	27908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017284	ATC	2	6	27913	27918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017284	ATT	2	6	27957	27962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017284	TAT	2	6	27970	27975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017284	T	6	6	27987	27992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017284	AATAA	2	10	28438	28447	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017284	TTA	2	6	28453	28458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017284	A	7	7	28506	28512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017284	ATT	2	6	28547	28552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017284	TGA	2	6	28553	28558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017284	ATG	2	6	28567	28572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017284	GAA	2	6	28620	28625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017284	TAA	2	6	28649	28654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017284	AAT	2	6	28690	28695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017284	A	7	7	28696	28702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017284	A	7	7	28739	28745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017284	A	7	7	28751	28757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017284	A	6	6	28773	28778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017284	TA	3	6	28781	28786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017284	A	6	6	28806	28811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017284	TATAAT	2	12	28814	28825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017284	AACAAA	2	12	28826	28837	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_017284	A	6	6	29243	29248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017284	A	6	6	29632	29637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017284	A	7	7	29674	29680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017284	A	7	7	29686	29692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017284	A	6	6	29708	29713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017284	TA	3	6	29716	29721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017284	A	6	6	29741	29746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017284	TATAAT	2	12	29749	29760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017284	AACAAA	2	12	29761	29772	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_017284	T	6	6	30176	30181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017284	A	6	6	30182	30187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017284	T	6	6	30223	30228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017284	A	6	6	30250	30255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017284	T	6	6	30324	30329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017284	A	6	6	30335	30340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017284	TA	3	6	30354	30359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017284	ATAA	2	8	30945	30952	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017284	A	6	6	30958	30963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017284	TA	3	6	30977	30982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017284	A	6	6	30991	30996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017284	AATTT	2	10	31011	31020	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017284	T	6	6	31468	31473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017284	T	7	7	31539	31545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017284	A	7	7	31548	31554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.